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首先應當明確的是，知網查重并不是只要論文作者將論文的相關部分加上腳注，這樣就會自動將該部分識別為引用部分，那知網究竟識別什么樣的腳注才算是引用呢？ 其實知網是有大數據的，也就是說，知網查重報告是通過比對論文的原文和知網數據庫當中的論文，如果，論文原文和知網數據庫當中的論文具有高度相似性，且該部分沒有被標注為引用部分，也就是說沒有在論文當中加上腳注，則該部分會被識別為重復部分，而如果該部分加上了腳注，是在知網的數據庫當中，并沒有相應的文獻，也就是說，所謂的加腳注，加的其實是假腳注，明明用的是某個學者的論文，但是卻標注成另外一個學者的名稱，這樣，知網就沒有辦法將該部分識別為引用部分。
最近有不少同學在 知網查重 時，發現有些同學的碩士研究生畢業論文的腳注和尾注被知網當作論文正文查重了，腳注部分大部分被標紅當作重復內容，慘不忍睹；但有些同學的碩士論文的腳注卻被知網正確識別出來了，沒有當作重復部分，如下圖所示： 那么，什么情況下知網查重能正確識別出論文的腳注部分呢？
word格式里面標注的腳注：知網對word格式論文里面的腳注并不全部都識別，如果單個腳注的字數很少，比如幾十字，或者100字左右，那么，知網基本上是不識別腳注的內容的，也即是說會被忽略掉，如果單個腳注的內容長一些，比如超過了200字，那么知網會識別這個腳注，重復就會被標紅處理。 pdf格式里面標注的腳注：知網對pdf格式論文里的腳注全部都識別。
不過隨著知網對pdf文件的識別能力越來越強，將來知網查重系統也能對pdf的腳注內容進行識別，從而杜絕腳注被標紅的不合理現象。 不管什么格式，建議在提交給知網查重入口 ( www.cnkivip.net )時，按照學校要求的格式進行提交是最穩妥的，學校要求提交word格式的話，你在自己提前論文檢測時，也提交word格式，如果學校要求提交pdf格式的話，自己在知網查重時也需要提交pdf格式。