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每個查重軟件都會有自己的對比庫，上傳進行檢測的論文都會與對比庫中的資料進行對比，來檢測論文內容是否重復。 不同查重軟件有不同的對比庫數據庫，且不同的查重軟件所能調用的數據庫數量不同。 這就是為什么同一篇論文，不同查重軟件檢測，會出現不同的查重結果，且同一個數據庫查重準確率也會不穩定。
在知網上進行論文檢測時，不單單只是檢測了論文正文，它還包括了封面，前言和目錄等等，如果第一次你只是檢測正文的話，可以原創度很高，但是在下一次的檢測中，你是將整篇論文以文檔的形式提交到知網查重軟件中時，可能檢測結果就會有差別。 ②知網數據庫在更新。 知網查重的數據庫會進行更新，這也是為什么部分論文在第一次使用知網查重之后部分文章是黑色字體，而在第二次再次利用知網進行查重之后，該部分黑色字體卻又會呈現黃色或者紅色的原因所在。
一般，核心期刊要求論文重復率低于15%，有的甚至要求低于10%。 普通期刊中，國家級期刊對論文重復率的要求為低于20%，省級期刊為30%。 重復率檢測不通過，編輯直接拒稿。 即使還能再修改降重，但明顯給編輯一種感覺，這篇文章原創度不高，從而影響文章的錄用。 由此可見，論文重復率的重要性。 因此，大部分學生都會選擇提前檢測。 目前高校、雜志社等其他科研機構官方默認知網的學術不端查重系統，畢竟知網的這個學術不端查重系統是國家層面重點支持項目。 然而，知網查重動輒幾百的查重費用太貴，對于學生黨來說有不小的壓力。 因此，市面上開始出現一些替代的查重軟件，比如Paperpass、WPS、維普、萬方等等。